Facultatea de Ştiinţe
A fost înființată în 1860 o dată cu Universitatea „Alexandru Ioan Cuza” Iași, ca o secție a Facultății de Științe (Fizică, Matematică și Științe Naturale). 
Facultatea de Ştiinţe Naturale
Cu mulți ani mai târziu, în 1948, secția de Științe Naturale devine Facultatea de Științe Naturale în cadrul căreia funcționează mai multe catedre (Botanică, Zoologie, Fiziologie vegetală, Fiziologie animală și Geologie).
Facultatea de Biologie-Geografie
În anul 1959, prin unirea colectivelor de cadre didactice care predau Științele biologice cu cele care predau științele geografice s-a constituit Facultatea de Științe Naturale-Geografie, care în 1963 devine Facultatea de Biologie-Geografie. Urmare a dezvoltării Secției de Geologie, în 1977 Facultatea își întregește denumirea în cadrul studierii Științelor Naturii devenind Facultatea de Biologie-Geografie-Geologie. 
Facultatea de Biologie
În anul 1990 s-a constituit Facultatea de Biologie.
- Stațiunea Biologică Marină „Prof. Ioan Borcea” Agigea (Constanţa):
- Director: CS III Dr. Emanuel Ștefan Baltag – Coordonator Stațiune de Cercetare
- Grădina Botanică „Anastasie Fătu” Iași:
- Director: Prof. univ. dr. Cătălin Tănase;
- Muzeul de Istorie Naturală Iași:
- Director: Prof univ. dr. Remus Ștefan Zamfirescu;
- Stațiunea Biologică „Petre Jitariu” Neamț:
- Director: Conf. univ. dr. Ioan Bogdan Robu.
Astfel, baza materială a Facultății din Iași este dezvoltată prin existența stațiunilor de cercetare de la Agigea (Marea Neagră), Potoci (Bicaz) și Piatra Neamț, prin Gradina Botanică, Muzeul de Istorie Naturală (primul din Țările Române) și un HERBARIUM foarte bogat în specii de plante. Facultatea formează și specialiști care pot desfășura activități în diferite domenii: întreprinderi care folosesc biotehnologii (fabrici de antibiotice, fabrici de industrializare a laptelui, a produselor alcoolice, vinuri, bere etc.), în spitale sau în domenii ecologice și de protecție a mediului. Facultatea are relații cu numeroase universități din Europa, cu care realizează schimburi de studenți și de cadre didactice.
